Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCSAPQ6IQ19 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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