Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG9BQ674R7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms