Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms