Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CEP170Q5SW79 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CEP170Q5SW79 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms