Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP188Q5SRE5 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms