Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTSL3PQ5NE16 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTSL3PQ5NE16 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTSL3PQ5NE16 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTSL3PQ5NE16 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTSL3PQ5NE16 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTSL3PQ5NE16 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms