Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDK2Q58EX2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms