Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SBK1Q52WX2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SBK1Q52WX2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms