Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC38Q502W7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms