Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CRY2Q49AN0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRY2Q49AN0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRY2Q49AN0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRY2Q49AN0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRY2Q49AN0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRY2Q49AN0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRY2Q49AN0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRY2Q49AN0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRY2Q49AN0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRY2Q49AN0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRY2Q49AN0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRY2Q49AN0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRY2Q49AN0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRY2Q49AN0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRY2Q49AN0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms