Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms