Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF8Q3BBV2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms