Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KNOP1Q1ED39 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
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