Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL24A1Q17RW2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
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