Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms