Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HADHQ16836 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HADHQ16836 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HADHQ16836 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HADHQ16836 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HADHQ16836 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HADHQ16836 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HADHQ16836 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HADHQ16836 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HADHQ16836 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HADHQ16836 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HADHQ16836 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HADHQ16836 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HADHQ16836 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HADHQ16836 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HADHQ16836 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HADHQ16836 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HADHQ16836 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HADHQ16836 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HADHQ16836 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HADHQ16836 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HADHQ16836 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HADHQ16836 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HADHQ16836 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HADHQ16836 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HADHQ16836 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HADHQ16836 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HADHQ16836 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HADHQ16836 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HADHQ16836 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HADHQ16836 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HADHQ16836 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HADHQ16836 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HADHQ16836 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HADHQ16836 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HADHQ16836 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HADHQ16836 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HADHQ16836 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HADHQ16836 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HADHQ16836 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HADHQ16836 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HADHQ16836 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HADHQ16836 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HADHQ16836 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HADHQ16836 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HADHQ16836 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HADHQ16836 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HADHQ16836 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HADHQ16836 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HADHQ16836 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HADHQ16836 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HADHQ16836 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HADHQ16836 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HADHQ16836 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HADHQ16836 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HADHQ16836 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HADHQ16836 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HADHQ16836 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HADHQ16836 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HADHQ16836 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HADHQ16836 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HADHQ16836 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HADHQ16836 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HADHQ16836 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HADHQ16836 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HADHQ16836 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HADHQ16836 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HADHQ16836 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HADHQ16836 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HADHQ16836 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HADHQ16836 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HADHQ16836 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HADHQ16836 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HADHQ16836 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HADHQ16836 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HADHQ16836 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HADHQ16836 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HADHQ16836 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HADHQ16836 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HADHQ16836 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HADHQ16836 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HADHQ16836 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HADHQ16836 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HADHQ16836 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HADHQ16836 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HADHQ16836 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HADHQ16836 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HADHQ16836 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HADHQ16836 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HADHQ16836 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HADHQ16836 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HADHQ16836 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HADHQ16836 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HADHQ16836 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HADHQ16836 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HADHQ16836 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HADHQ16836 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HADHQ16836 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HADHQ16836 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HADHQ16836 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms