Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDR2Q16832 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms