Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPROQ16827 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms