Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
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