Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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