Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACKR1Q16570 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms