Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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RPE65Q16518 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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