Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PRR4Q16378 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms