Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LAMA4Q16363 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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