Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTRK3Q16288 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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