Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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CCDC6Q16204 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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CCDC6Q16204 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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