Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPTX1Q15818 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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