Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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