Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
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PTPRKQ15262 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PTPRKQ15262 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
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PTPRKQ15262 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PTPRKQ15262 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
PTPRKQ15262 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC27.58■■■□□ 2
PTPRKQ15262 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC27.58■■■□□ 2
PTPRKQ15262 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
PTPRKQ15262 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC27.58■■■□□ 2
PTPRKQ15262 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC27.58■■■□□ 2
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PTPRKQ15262 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
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PTPRKQ15262 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
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PTPRKQ15262 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRKQ15262 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRKQ15262 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRKQ15262 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRKQ15262 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PTPRKQ15262 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PTPRKQ15262 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRKQ15262 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRKQ15262 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRKQ15262 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRKQ15262 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRKQ15262 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRKQ15262 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PTPRKQ15262 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRKQ15262 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRKQ15262 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRKQ15262 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRKQ15262 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRKQ15262 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRKQ15262 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
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