Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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