Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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