Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
GAPVD1Q14C86 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GAPVD1Q14C86 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GAPVD1Q14C86 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GAPVD1Q14C86 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms