Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ODF1Q14990 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms