Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE1CQ14123 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms