Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCARB2Q14108 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms