Protein–RNA interactions for Protein: Q14019

COTL1, Coactosin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COTL1Q14019 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COTL1Q14019 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COTL1Q14019 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
COTL1Q14019 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COTL1Q14019 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COTL1Q14019 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COTL1Q14019 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COTL1Q14019 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COTL1Q14019 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COTL1Q14019 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COTL1Q14019 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COTL1Q14019 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COTL1Q14019 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms