Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNTB1Q13884 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms