Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PKP1Q13835 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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