Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
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