Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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