Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
IRF5Q13568 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF5Q13568 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms