Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RESTQ13127 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RESTQ13127 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RESTQ13127 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RESTQ13127 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RESTQ13127 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RESTQ13127 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RESTQ13127 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RESTQ13127 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RESTQ13127 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RESTQ13127 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RESTQ13127 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RESTQ13127 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RESTQ13127 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RESTQ13127 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RESTQ13127 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RESTQ13127 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RESTQ13127 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RESTQ13127 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RESTQ13127 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RESTQ13127 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RESTQ13127 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RESTQ13127 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RESTQ13127 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RESTQ13127 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RESTQ13127 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RESTQ13127 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RESTQ13127 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RESTQ13127 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RESTQ13127 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RESTQ13127 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RESTQ13127 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RESTQ13127 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RESTQ13127 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RESTQ13127 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RESTQ13127 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RESTQ13127 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RESTQ13127 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RESTQ13127 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RESTQ13127 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RESTQ13127 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RESTQ13127 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RESTQ13127 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RESTQ13127 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RESTQ13127 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RESTQ13127 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RESTQ13127 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RESTQ13127 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RESTQ13127 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RESTQ13127 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RESTQ13127 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RESTQ13127 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RESTQ13127 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RESTQ13127 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RESTQ13127 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RESTQ13127 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RESTQ13127 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RESTQ13127 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RESTQ13127 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RESTQ13127 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RESTQ13127 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RESTQ13127 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RESTQ13127 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RESTQ13127 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RESTQ13127 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RESTQ13127 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RESTQ13127 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RESTQ13127 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RESTQ13127 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RESTQ13127 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RESTQ13127 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RESTQ13127 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RESTQ13127 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RESTQ13127 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RESTQ13127 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RESTQ13127 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RESTQ13127 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RESTQ13127 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RESTQ13127 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RESTQ13127 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RESTQ13127 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RESTQ13127 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RESTQ13127 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RESTQ13127 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RESTQ13127 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RESTQ13127 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RESTQ13127 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RESTQ13127 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RESTQ13127 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RESTQ13127 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RESTQ13127 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RESTQ13127 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RESTQ13127 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RESTQ13127 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RESTQ13127 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RESTQ13127 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RESTQ13127 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RESTQ13127 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RESTQ13127 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RESTQ13127 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms