Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF1Q13077 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF1Q13077 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms