Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms