Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC173Q0VFZ6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms