Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNA1Q09470 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms