Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DHX9Q08211 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms