Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms