Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms