Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms